Korean Journal of Biological Psychiatry

서론
Serine-threonine kinase 활성을 가진 cAMP-dependent protein kinase(PKA)는 세포내에서 세포성장, 분화 및 사망에 관련되어 있다(Taylor등 1990；Montminy 1997). PKA는 두 개의 조절단량체(regulartory subunit；R2)와 두 개의 촉진단량체(catalytic subunit；C2)로 구성되어져 있는데, cAMP가 조절단량체에 결합하여 효소의 구조가 변하면, holoenzyme(R 2C 2)이 조절단량체와 촉진단량체로 분리되고, 촉진단량체가 활성을 띠게 된다. PKA I과 PKA II는 각각 다른 조절단량체 I과 II를 가지나, 촉진단량체는 동일한 것을 사용한다(Bramson등 1983). 조절단량체 I은 성장촉진 단백질로 작용하고, 조절단량체 II는 성장저해 및 분화유도 단백질로 작용한다(Cho-Chung등 1995). 정상적인 세포나 성장이 정지된 세포에서는 PKA II가 주로 발현되고, 암세포나 유사분열하는 세포에서는 PKA I가 주로 발현된다(Ciardiello와 Tortora 1998).
상피세포성장인자(epidermal growth factor；EGF)를 비롯한 성장인자는 mitogen-activated protein kinase(MAPK) 신호전달 과정을 활성화시켜 세포증식을 유도한다(Kannan등 1997). EGF에 의해 증식되는 세포에 cAMP를 매개로 한 PKA 활성이 유도되면 MAPK 신호전달 과정은 저해된다. PKA I은 EGF 수용체와 MAPK를 연결하는 중간단계에서 직접 작용하고, PKA II는 PKA I, ras 및 raf-1을 저해하여 간접적으로 MAPK 활성을 저해한다(Ciardiello와 Tortora 1998).
흰쥐 pheochromocytoma 세포로부터 분리된 PC12 세포는 신경성장인자(nerve growth factor；NGF)에 의해 신경전달물질인 아세틸콜린(acetylcholine)과 카테콜아민(catecholamine)을 합성, 저장 및 분비하며 형태학적으로도 신경돌기(neurite)를 뻗는 신경성세포로 분화되나(Greene과 Tischler 1976；Schubert와 Klier 1977), EGF에 의해서는 세포의 증식만 유도된다(Salomon등 1995). 이에 반하여, A123.7 세포는 PC12 세포에서 pHL-REVB 벡터가 안정하게 발현되는 것으로 PKA I의 활성은 완전하게, PKA II의 활성은 약 80% 감소된 세포주이다(Scheibe등 1991). A123.7 세포는 cAMP를 증가시키는 물질들이나, cAMP 등에는 신경성세포로 분화되지 않는 대신에 NGF에 의해서는 분화를 시작한다(Ginty등 1991).
PKA 활성은 tyrosine hydroxylase 전사조절에는 관련되어 있지 않으나(Nankova등 1996), 콜린성 니코틴 수용체(neuronal nicotinic cholinergic receptor；nAcChRs)의 전사를 촉진하고(Madhok등 1995), PKA II의 활성은 아세틸콜린 생합성효소(choline acetyltransferase；
ChAT)와 소포성 아세틸콜린 수송체(vesicular acetylcholine transporter；VAChT)의 전사를 동시에 촉진한다(Wu등 1984；Inoue등 1995；Shimojo등 1998).
본 연구에서는 reverse transcription-polymerase chain reaction에 기초를 두어 Liang과 Pardee에 의해 개발된 differential display polymerase chain reaction(DD-PCR) 방법(1992)을 사용하여, Alzheimer 질환의 치료 가능성을 타진하기 위하여 cholinergic gene locus의 발현을 조절하는 유전자를 스크리닝하고자 PC12 세포와 A123.7 세포간에 차별화 되어 발현되는 유전자를 검색하고자 하였다.
실험방법
1. 세포 배양
본 실험에 사용한 PC12 세포는 American Type Culture Collection에서 구입한 것을, PKA가 결핍된 PC12 세포(A123.7)는 Harvard 의대 Wagner 교수로부터 분주받아 사용하였다. PC12 세포와 A123.7 세포는 F12-DMEM (Gibco /BRL)에 열처리된 10% fetal bovine serum(FBS)(Gibco/BRL)과 5% horse serum이 첨가된 배양액에서 37℃, 10% CO 2 상태로 배양하였다(Scheibe등 1991).
2. RNA의 분리 및 정제
RNA를 다룰 모든 용액은 0.1% diethyl-pyrocarbonate(DEPC)에 전 처리된 증류수를 사용하였다. RNA의 추출은 Chomczynski와 Sacchi의 방법(1987년)을 이용한 RNAzol TMB (Biotecx)을 이용하였다. 각각의 수확된 세포는 PBS로 3 번 세척하고, 세척된 세포에 2ml의 RNAzol TMB 용액을 넣어 섞은 후, 얼음에 15분간 보관한 뒤, 0.1 부피의 클로로포름을 넣어 다시 섞어 주었다. 이후, 얼음에서 15 분간 보관한 뒤 원심분리하여 상층액을 얻고 2배 부피의 100% 에탄올을 첨가한 후, 잘 섞어 -70℃에서 30분간 보관한 뒤 4℃에서 14,000rpm으로 20분간 윈심분리하였다. 침전물을 70% 에탄올로 세척한 후 얻어진 RNA는 DEPC-처리된 멸균수에 녹였다. 추출한 RNA는 UV/visible 분광광도계를 사용하여 260nm와 280nm에서 흡광도를 측정한 후, O.D 260nm / O.D 280nm의 비율이 1.9 이하이면 RNase free-DNase I 처리와 페놀 / 클로로포름 처리를 하였다. 이렇게 해서 얻어진 RNA는 적당한 양으로 분주하여 -70℃에 보관하였다.
3. RNase free-DNase I 처리
RNase가 오염되지 않은 1.5ml 튜브에 RNA 50μg, 0.25μl의 40U/μl RNase inhibitor(Promega), 10μl의 RNase free-DNase I(Promega), 5μl의 0.1 M Tris-HCl(pH 8.3), 5μl 0.5 M KCl과 5μl의 15mM MgCl 2을 섞은 뒤 멸균수로 50μl가 되도록 채우고 37℃ 항온조에서 30분간 반응하였다. 그 후 페놀(pH 4.3)/클로로포름(3：1)을 50μl 더한 뒤 섞어 준 후 상온에서 14,000 rpm, 4℃에서 2분간 원심분리하였다. 얻어진 침전물은 RNA 정제와 같은 방법으로 다루었다.
4. Formaldehyde 겔 전기영동
Formaldehyde 겔 전기영동은 아가로스 0.6g에 5ml의 10x MOPS, 8.9ml의 formaldehyde, 0.5μl의 ethidium bromide를 첨가하여 겔을 만들었고, 5μl의 RNA 샘플에 15μl의 RNA-loading dye[0.72ml formamide, 0.16ml 10X MOPS, 0.26ml의 37% formaldehyde, 0.18ml 멸균수, 0.1ml 80% glycerol, 0.08ml bromophenol blue가 포함된 용액]를 섞어 전기영동을 수행하였다.
5. Reverse transcription
cDNA합성은 0.2μg RNA, 20 μM dNTP, 20 pmole oligo(d)T 시발체, 반응완충용액 [50mM Tris-HCl(pH 8.3), 75mM KCl, 3mM MgCl 2, 10mM DTT]을 섞어 65℃에서 5분간 반응시키고, 42℃에서 10분간 반응시킨 후, 1μl의 MMLV-역전사효소(reverse transcriptase；200 U/μl)를 가하여 42℃에서 50분간 반응시키고, 75℃에서 5분간 가열하였다. 이때, 사용하는 oligo(d)T는 H-T 12MA, H-T 12MG 및 H-T 12MC(표 1)이고, 하나의 샘플 당 3개의 cDNA를 합성하여 총 6개의 cDNA를 합성하였다.
6. Differential display-polymerase chain reaction (DD-PCR)
DD-PCR은 RNA Image Kit(GenHunter, Brookline, MA)를 사용하여 수행하였다. 각각의 세포로부터(PC12/A123.7) 얻은 RNA를 역전사시켜 만든 2μl cDNA, 2μM dNTP, 4pmole 임의의 시발체(H-AP)(GenHunter), 20pmole oligo(d)T 시발체(H-T 12MA, H-T 12MG, H-T 12MC), 1μl α-[35S] dATP(1,200 Ci/mmole, Amersham), 1 unit Taq DNA 중합효소(Perkin Elmer), 반응완충용액 [50mM KCl, 10mM Tris-HCl(pH 9.0 at 25℃), 0.1% Triton ⓡX-100, 1.5mM MgCl 2]를 섞어 94℃에서 5분간 변성시켰다. PCR 반응은 94℃에서 30초간 변성, 40℃에서 2분간 annealing, 72℃에서 30초간 중합하는 반응을 40회 반복하고, 72℃에서 10분간 연장하였다. 이때 사용하는 임의의 시발체는 H-AP1, H-AP2, 및 H-AP3의 세 가지이고, 그 각각에 대해서 사용된 oligo(d)T는 H-T 12MA, H-T 12MG 및 H-T 12MC를 이용 9개의 시발체 조합을 가지고 두 가지 세포를 사용하여 총 18개의 DD-PCR 반응을 수행하였다. DD-PCR은 PCR 반응의 오류를 최소화하기 위하여 같은 반응을 3회 반복 실시하였다.
7. Polyacrylamide 겔 전기영동(PAGE)
Polyacrylamide(6%) 겔은 Sigma coat로 coating된 플레이트를 사용하였다. DD-PCR 반응 샘플 3.5μl당 2μl loading dye[0.25% bromophenol blue, 0.25% xylene cyanole FF, 15% Ficoll(Type 400；Pharmacia)]를 넣어 전기영동하였다.
8. DEST의 획득과 재증폭
필름 상에 나타난 각각의 세포에서 차별적으로 발현된 밴드를 찾아, 이에 상응하는 겔 상의 밴드를 칼로 오려냈다. 오려낸 밴드는 microcentrifuge 튜브에 담아 100μl의 멸균수를 넣고 15분간 끓인 후 2분간 원심분리하여 상층액을 취하였다. 상층액에 10μl 3 M sodium acetate, 5μl glycogen(10mg/ml) 및 450μl 100% 에탄올을 넣고 -70℃ 냉동고에 30분간 넣어둔 후, 4℃에서 10분간 원심분리를 하여 침전물을 얻었다. 얻어진 침전물은 85% 에탄올로 세척한 후 말려서 10μl의 멸균수에 녹여 PCR 재증폭에 사용하였다. 재증폭은 4μl의 오려낸 DNA, 20 μM dNTP, 4 pmole H-AP 시발체, 20 pmole oligo(d)T 시발체, 1 unit Taq DNA 중합효소, 반응완충용액 [50mM KCl, 10mM Tris-HCl(pH 9.0 at 25℃), 0.1% Triton ⓡX-100, 1.5mM MgCl 2]를 섞어 94℃에서 5분간 변성시켰고, 94℃에서 30초간 변성, 40℃에서 2분간 annealing, 72℃에서 30초간 중합하는 반응을 40회 반복하고, 72℃에서 10분간 연장하였다. 이때 사용하는 시발체는 DD-PCR 반응시 사용했던 것과 같은 종류의 시발체를 사용하였다. PCR 반응물 10μl를 아가로스 겔 전기영동 한 후, 각각의 밴드의 크기가 X-ray 필름에서 예측한 크기와 일치하는지 확인하였다.
9. 증폭된 DEST의 클로닝과 transformants 검색
증폭된 cDNA 조각들을 클로닝 하기 위하여 pZErO-2 TM벡터(Invitrogen)를 사용하였다. H-AP 시발체와 oligo(d)T 시발체는 모두 HindIII 제한효소 자리가 있어, 재증폭된 DEST와 pZErO-2 TM벡터는 각각 HindIII(BMS)으로 분해하고, T4 DNA ligase(BMS)를 사용하여 16℃에서 3시간 반응하였다. Ligation 산물은 FSB 용액으로 만든 XL1-Blue(Escherichia coli) competent cell을 42℃, 90초간 열 충격을 가하여 형질변환(transformation)하였다. 이 형질전환체는 1mM의 IPTG과 kanamycin(25μg/ml)이 첨가된 LB plate에서 살아남는 콜로니를 선택하였고 확인은 PCR을 수행하였다.
10. DNA 염기서열 결정 및 분석
DNA 염기서열 결정은 Sanger와 Coulson의 chain ter-mination 방법(1975)을 원리로 한 Amersham사의 USB se-quencing 2.0 kit(Sequnase 2.0)를 사용하였고, α-[ 35S] dATP(1,200 Ci/mmole, Amersham)으로 DNA를 labeling시켰다. 클로닝하여 확인된 DEST DNA 10μg을 변성시키고, M13 reverse와 forward 시발체를 65℃에서 2분간 annealing시키고, 서서히 35℃까지 식혀 α-[35S] dATP, DTT(0.1 M), labeling 혼합물, Sequenase 2.0을 첨가하여 상온에서 2~5분간 labeling 반응을 하고, termination 혼합물이 첨가된 튜브에 labeling 혼합물을 넣어 37℃에서 5분간 반응시키고, 4μl의 정지 용액을 첨가하여 반응을 정지시켰다. 이를 sequencing 겔에 전개하였다. 전개된 겔을 Phosphoimage analyzer(Bio-Rad)로 분석하여 염기서열을 결정하였다. 얻어진 염기서열은 BLAST 프로그램을 사용하여 GenBank에서 유사성을 확인하였다(Altschu등 1997；http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST).
11. Northern analysis
Formaldehyde(1.2%) 겔에서 RNA를 전개시키고, 이 RNA를 포함하고 있는 겔을 10X SSC에서 10분간 씻어준 후(3회 반복), upward capillary blotting 방법으로 12시간 이상 nitrocellulose filter로 이전시켰다. RNA가 이전된 filter를 UV-crosslinker(Bio-Rad)로 cross-linking시켰다. Probe는 BL-AST 검색 결과 유사성이 95% 이상인 KC1-5 DEST를 사용하였고, 이를 PCR 반응으로 재증폭하여 ECL kit(Amercham)의 horseradish peroxidase를 labeling시키고, 6시간 이상 hybridization 한 후, 42℃의 첫 번째 세척액으로[6 M urea, 0.4% SDS, 0.5x SSC] 20분간 2회 세척하고, 두 번째 세척액으로 [2X SSC] 상온에서 5분간 2회 세척하여, ECL-detection solution(Amersham)으로 반응시킨 후에 X-ray 필름에 1시간 정도 노출 및 현상시켜 결과를 확인하였다.
결과
1. DD-PCR과 DEST의 선택
PC12 세포와 A123.7 세포의 mRNA 수준에서의 발현 양상을 비교하기 위하여 sense 시발체로는 H-AP1, H-AP2 및 H-AP3(표 1)를 사용하였고, antisense 시발체로는 H-T 12MA, H-T 12MG 및 H-T 12MC(표 1)를 사용하여 PCR 수행한 후, 6% denaturing 겔에 전기영동하여 그림 1과 같은 결과를 얻었다. 그 중, 두 세포간 발현정도 차이가 현저한 12개의 DEST를 선택하여 화살표로 표시하였다. 이 중에는 한 세포에서만 발현하는 DEST 뿐 아니라, 발현양의 현저한 차이를 보이는 DEST까지 선택하였다. 그리고 이 DEST 들은 다음과 같이 명명하였다. DEST의 명명법은, 첫 번째 알파벳의 P는 PC12 세포를 K는 A123.7 세포를 나타낸 것이고, 두 번째 알파벳의 A, G 및 C는 각각 antisense 시발체인 oligo(d)TA, G 및 C를 나타낸 것이고, 세 번째 숫자의 1, 2 및 3은 각각 sense 시발체인 H-AP1, 2 및 3를 나타낸 것이다. 마지막 숫자는 동일 세포, 동일 시발체를 사용한 경우 DEST가 2개 있으면, 밴드 크기가 큰 것부터 1 및 2로 숫자매김을 하였다. 그리하여 KC1-1, KC1-2, KC1-3, KC1-4, KC1-5, KC2-1, KC3-1, KC3-2, KA3-1, KA1-1, PG1-1 및 PG1-2의 총 12개의 DEST를 얻었다(그림 1).
2. DEST의 획득과 재증폭
DD-PCR 반응에서 선택된 총 12개의 DEST들은 겔 상에서 보이는 밴드로부터 DNA 단편을 획득하였고, 동일 시발체를 사용하여, 같은 조건에서 재증폭 하였다(그림 2). 이 중 11개의 DEST들은 단일 밴드로 재 증폭이 이루어졌고, 또한 6% denaturing 겔과 1.5% 아가로스 겔 상에서 상대적인 위치를 확인한 결과 정확하게 재증폭 되었음을 확인하였다.
3. DEST의 클로닝과 염기서열 결정 및 분석
재증폭이 확인된 각각의 DEST들은 pZErO-2 벡터(Invitrogen)에 클로닝하였다. 재증폭하여 HindIII로 자른 DEST들을, pZErO-2 벡터의 HindIII 자리에 ligation하여 총 7개의 DEST인 KC1-1, KC1-2, KC1-3, KC1-5, KC2-1, KA3-1 및 PG1-1을 얻었고, 염기서열을 결정하여, BLAST 프로그램을 사용하여 유사성을 확인하였다(Altschul등 1997；표 2). KC1-5 DEST는 생쥐의 topoisomerase 저해제에 의해 억제되는 유전자, TIS(Onishi와 Kizaki 1996)와 생쥐의 세포사망과 관련된 유전자, MA-3(Shibahara등 1995) 모두에 95%씩의 유사성을 가지고 있고, 두 유전자는 서로 DNA 염기서열이 98%이상, 아미노산 서열이 99.6%를 가지는 것으로 나타났다(그림 3).
PG1-1 DEST는 transposon Tn10 DNA, 3'-end와 98%의 유사성을 가지고 있는 것으로 나타났다(자료 미제시). 나머지 5개의 DEST는 BLAST 검색결과 현재까지 밝혀진 유전자와 상응하는 유전자가 없었다(표 2).
4. Northern analysis를 통한 DEST의 확인
A123.7 세포와 PC12 세포에서 차별적으로 발현되어 확보된 7개의 DEST들 중, 세포사망과 관련되어 있다고 보고되어 있고, PKA 활성에 의해 저해되는 MA-3 또는 TIS 유사 KC1-5 DEST를 선택하여 Northern analysis 수행 결과 PC12 세포에서는 발현되지 않았고, A123.7 세포에서만 발현되었다(그림 4). 이를 통해 MA-3/TIS 유사 KC1-5 DEST는 PKA 활성이 없는 조건에서 발현됨을 확인하였다.
고찰
PC12 세포와 A123.7 세포에서 차별적으로 발현되는 유전자를 DD-PCR 반응을 통해 비교 검색한 결과 본 연구에서는 7개의 차이나는 DEST를 확보하였다. 이 DEST들 중 6개는 A123.7 세포에서 과발현되었고, 1개의 DEST는 PC12 세포에서만 발현되었다. 이들 중 KC1-5와 PG1-1 DEST는 BLAST 검색 결과 유사성이 90% 이상인 유전자가 각각 존재하였고, 나머지 5개의 DEST들은 BLAST 검색결과 현재까지 밝혀진 유전자와 상응하는 유전자가 없었다.
KC1-5 DEST는 BLAST 검색 결과 2개의 유전자와 95%의 유사성을 갖고 있는데, 하나는 생쥐의 세포사망과 관련 있는 유전자, MA-3로 나타났고(Shibahara등 1995), 다른 하나는 topoisomerase 저해제에 의해 억제되고, RVC lymphoma 세포에서 클로닝된 유전자, TIS로 나타났다(Onishi와 Kizaki 1996). 이 두 유전자는 각각 다른 방법으로 클로닝 되었지만 DNA 염기서열 상으로는 98%이상의 유사성을 가지고 있고, 아미노산 서열상으로는 99.6%의 유사성을 가지고 있었다. 표 2에 있는 KC1-5 DEST의 BLAST 검색 결과 비교적 작은 부분이 MA-3 또는 TIS 유전자의 3'-end에서 각각 95%의 유사성이 있었다. 이는 DD-PCR cDNA가 3'-end 부분부터 증폭되고, PC12 세포주가 흰쥐에서 유래되었기에 KC1-5 DEST는 흰쥐의 MA-3/TIS famlily에 속한다고 추정된다.
MA-3 유전자는 Shibahara등(1995)에 의해 DD-PCR 방법으로 클로닝 된 유전자로, 세포사망이 유도된 PC12, B cell, T cell 및 thymocyte에서 발현하는 유전자로서, PC12 세포의 경우, NGF 제거로 인해 사망이 유도된 세포에서 발현되었다. Yao등(1998)의 보고에 의하면, NGF에 의해 세포가 분화하기 위해서는, MAP와 ERK의 활성이 필요하고, 이들의 활성에는 PKA가 매개되어 있다. 이 결과로, 분화된 PC12 세포는 NGF 제거에 의해 PKA 활성이 저해되고, 이 세포는 A123.7 세포와 같은 PKA 저해조건에서 MA-3를 발현시켰다. Shibahara등(1995)의 보고에 의하면, 건강한 세포에 일시적으로 MA-3를 과발현 시켜도 세포사망은 유도되지 않는다. 본 실험에서 A123.7세포와 PC12 세포의 성장속도를 육안으로 비교해 보아도 별다른 차이를 보이지 않았다. 이런 결과를 통해 MA-3는 단일 단백질로서 세포사망을 유도하기보다는, 알려지지 않은 결합단백질이 존재할 것이라고 추정된다.
TIS 유전자는 DNA에 손상을 가져오는 topoisomerase 저해제가 처리된 RVC lymphoma 세포에서 발현이 억제되고, 정상적인 topoisomerase 활성에 의해서는 발현 유도되는 유전자이다(Onishi와 Kizaki 1996). Topoisomerase는 포유동물에서 topoisomerization을 촉진하여 DNA 복제, 전사 및 체세포 분열을 조절하는데, topoisomerase I 저해제인 campto-thecin는 단일 가닥 DNA에 손상을 일으키고, topoisom-erase II의 저해제인 etopside는 두 가닥 DNA에 손상을 가해 cleavable complex를 만들어 세포사망을 유도한다(Hsiang등1985). TIS는 cleavable complex를 형성시키지 못하는 topoisomerase II 저해제인 ICRF-154에 의해서는 발현되지 않는 특징이 있다. Garcia-Bermejo등(1998)의 보고에 의하면, PKA와 topoisomerase II는 서로 상호 보완적 역할을 한다고 한다. 이 결과로, PKA가 불활성화 된 A123.7 세포에서, topoisomerase II가 활성화되어 TIS 유전자가 발현되었다고 추정된다. MA-3는 전반적인 생쥐세포에서 적은 양으로 발현되고, 흉선에서 주로 발현되며, 여러 동물에서 진화적으로 보존되어 있다(Shibahara등 1995). TIS도 생쥐의 전반적인 조직에서 발현되나, 간에서 주로 발현되고, 심장과 골격근에서는 거의 발현되지 않는다(Onishi등 1998).
PG1-1 DEST는 PC12 세포에서만 발현되고, transposons, Tn10 DNA와 98%의 유사성이 있었다(Wang등 1998). Tn10 DNA는 아직까지 세포의 사망이나 분화에 관련되어 그 기능이 밝혀지지 않았다. 단지 박테리오파지와 레트로 바이러스 DNA의 삽입, 복제 및 이동을 조절하고, 인간의 유전체(human genome)에서도 transposonal factor로써 기능을 한다고 알려져 있다(Wang등 1998). Tn10-like 유전자는 myeloblastic leukemia에서 분리된 ML-1 세포와 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate(TPA)에 의해 분화된 ML-1에서 차별적으로 발현되는 유전자를 DD-PCR 방법으로 검색한 결과, TPA에 의해 분화된 ML-1에서 주로 발현되었다(Wang등 1998). 이 결과로, Tn10 유전자는 분화하는 세포에서 발현되고, PKA 활성에 의해 발현 유도되는 유전자임을 확인하였다. 이번 연구를 통해 MA-3/TIS 유전자는 PKA 활성에 의해 억제되고, transposon Tn10 유전자는 PKA 활성에 의해 발현 유도된다는 것을 확인하였다. 본 연구에서 확인된 MA-3/TIS와 transposon Tn10 유전자를 PKA와 관련지어 지속적으로 연구한다면, 세포의 증식, 분화 및 사망 조절 기작을 이해하는 데 도움이 될 것으로 기대된다.
결론
cAMP-dependent protein kinase(PKA) 신호전달은 진핵세포에서 세포증식, 분화 및 사망에 관련되어 있다. 세포의 생명주기에서 PKA의 역할을 규명하고, PKA 신호전달 과정을 이해하기 위해서 PKA에 의해 영향을 받아 발현이 증가되거나 감소되는 유전자를 검색할 필요가 있다. PKA 결핍 PC12 세포 즉, A123.7 세포와 PC12 세포간에 차별적으로 발현되는 유전자를 differential display polymerase chain reaction 방법으로 검색하여 모두 7개의 differential expressed sequence tags(DEST)을 확보하였다. 이 중 5개의 DEST는 BLAST 검색결과 아직까지 밝혀지지 않은 유전자이고, 2개의 DEST는 90% 이상의 유사성을 가진 유전자로 밝혀졌다. A123.7 세포에서 발현 양이 현저하게 증가하는 KC1-5 DEST는 생쥐의 세포사망과 관련있는 유전자인 MA-3과 생쥐 topoisomerase 저해제에 의해 억제되는 유전자인 TIS에 각각 95%씩의 유사성이 있었다. MA-3은 세포사망이 유도된 여러 세포들에서 발현되고, 그 중 NGF 제거로 인해 세포사망이 유도되는 PC12세포에서 특이적으로 발현된다. TIS 유전자는 DNA에 손상을 가져오는 topoisomerase 저해제가 처리된 RVC lymphoma 세포에서 발현이 억제되고, 정상적인 topoisomerase 활성에 의해서는 발현이 유도되는 유전자이다. KC1-5 DEST는 Northern analysis를 통해 A123.7 세포에서만 발현되는 것이 확인되었다. PC12 세포에서만 발현되는 PG1-1 DEST는 transposon Tn10과 98%의 유사성을 보인다. Transposon Tn10은 12-O-tetradecanoylhorbol-13-acetate에 의해 분화되는 myeloblastic ML-1 세포에서 과발현되는 유전자이다. 본 연구를 통해, MA-3/TIS 유전자는 PKA 활성에 의해 억제되고, transposon Tn10 유전자는 PKA 활성에 의해 발현이 유도된다는 것을 확인하였다.